隨著網絡的不斷發展，期刊論文的投稿方式也逐步趨向了在線投遞，如今大部分期刊在各自的官網中都會表明在線投稿系統的地址。特別是SCI期刊的投遞，郵寄方式已不能滿足國外期刊快速便捷的需求，因此在線投稿也就成為了SCI期刊的主要投稿方式之一。不過在線向SCI期刊投稿，賽恩斯認為有必要注意下列問題。
　　一、應注意查詢擬投稿期刊的最新要求，以便在稿件的準備中盡早開始遵循期刊的習慣和格式。
　　二、投稿時應嚴格遵循期刊的相關要求，按規定的程序填寫或添加投稿信息，如投稿信、摘要、文件類型、輔助信息、圖件、建議的審稿人等，以滿足期刊的要求。
　　三、Email地址必須準確，有些期刊要求主要作者和通信作者有相互獨立的用戶名和密碼，并且主要是與通信作者進行投稿及投稿后的聯系，這也是在投稿時需要注意的。
　　四、除了Email和FTP投稿形式需要一次性投稿外，通過網頁的投稿可以采取暫時保存的形式分多次完成投稿任務，在最終遞交稿件前，投稿系統需要作者確認所有項目均已完成并且允許作者修改。通常情況下，投稿完成以后就不允許作者對已投的稿件進行修改，除非編輯和出版商要求作者作某些修改。
　　五、投稿成功以后，作者通常會收到一份來自編輯或系統的確認函，作者可根據確認函提供的稿件編號跟蹤稿件狀態及進行投稿后的聯系(如要求加快稿件處理速度)，可通過投稿系統規定的渠道或Email與編輯聯絡。
　　六、當稿件需要修改時，編輯會通過郵件通知作者需要修改的細節，作者應該通過指定的方式遞交修改稿(投稿系統，Email或FTP)。
　　當然了，在線成功地將稿件投遞出去之后，并非就完事了，還需要做好稿件追蹤、稿件退修和稿件修回等工作：
　　1.稿件追蹤。通常情況下，如果投稿2周仍無任何有關稿件收到的信息，那么可打電話、發e-mail或寫信給編輯部核實稿件是否收到。由于好的期刊收到的稿件過多，編輯部可能存在疏漏的情況，所以稿件追蹤的工作有必要做好。
　　2.稿件退修。幾乎所有的經審查學術水平達到出版要求的自由來稿，在發表前都需要退給作者修改其表述及編輯格式，如壓縮文章篇幅、重新設計表格、改善插圖質量、限制不規則縮寫詞使用等。通常退給作者修改的材料包括原稿、審稿專家意見和一封編輯的信。
　　一般來說，退給作者修改的稿件并不代表文章已經被接受，因為文章最終接受與否取決于作者對文章關鍵性重要內容和表述方式的修改能否達到審稿專家及編輯的要求。所以，當作者收倒退修稿后，首先應該仔細地閱讀退修信和審稿專家意見，然后再考慮能否或愿意接受審稿專家或編輯的意見，進行修改稿件。
　　3.稿件修回。一般從主編回信和審稿人修回意見可看出文章錄用的可能性，因為主編的回信通常會特別提到文章的科學先進性，審稿人對文章總的評價中也會提到對文章是否感興趣等。所以建議修回不要倉促，應反復閱讀、理解審稿人的問題，然后對每位審稿人提出的意見要逐條回答，同時對修回稿中已修改的地方要具體標明，并給主編回信，感謝給文稿提出的修改意見，并指出按修改建議已作的修改，未作修改的地方要說明理由。
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