在學術論文中，討論是將所得結論或研究結果，從理論上進一步分析，科學地推論和評價，證實所得結果的可靠性，闡明具有科學性、先進性的論據，從而取得大家的公認。因此，在醫刊匯看來，寫作學術論文的討論部分時，應注意以下的要點。
　　一、討論要有其內在的邏輯性。文章可以從對實驗結果、實驗現象開始分析，逐漸地討論到引起這個現象的機理。在這個過程中可以引入他人的觀點進行比對或者佐證，也可以從實驗結果的正反兩方面進行論述，得出自己的觀點并進行評述。為了體現出思維的嚴密性、邏輯的嚴謹性，在討論的過程中應堅持普遍聯系的方法和辯證的方法分析問題、認識問題。
　　二、數據的處理盡量采用圖、表、文的綜合表達方式。避免羅列數據，要體現出對數據的深度分析，形成的圖和表要有自明性；避免圖、表、文相互重復說明同一組數據，只需用簡明扼要的文字，說清楚圖或表中具有結論性的數據即可。除了描述數據或者圖中的趨勢之外，在去除差異的前提下，應盡可能地使用統計方法體現出對數據的分析，避免出現用特殊的數據產生一般性的錯誤結論。
　　三、討論過程中，應盡量少使用“可能是”這樣的詞語。因為討論就是一個不斷求證、去偽存真的過程，對于產生的正面或者負面的實驗結果的原因，作者應該通過假設的方法去分析。但不要只是通過“可能是”提出假設就結束，而是應當進一步地設計實驗進行求證。提出假設，僅僅是理論上的可能性，而設計實驗驗證，則是尋找實踐上的可能性。如此，理論和實踐相符合則說明假設的正確，反之則需要進一步的討論和分析。
　　四、討論過程中要將正面的結果和負面的結果相結合。在任何一個研究當中，判斷無誤的負面實驗是提高文章深度的前提。研究和討論的過程就是不斷排除錯誤的方法找到正確方法的過程。通過對比正反的實驗結果可以使得作者看問題的角度更加全面、視野更加開闊，使文章更加有說服力。
　　五、文獻引用應避免的現象。一是有些作者喜歡大量引用國外文獻，目的不是為了更好地總結，而是為了證明自己的閱讀量，甚至有大量的文獻都是二次引用，連原文都沒有看到；二是有些作者不引用或者沒有規范地引用文獻，要么是認為不重要，要么是沒有找到，要么是故意回避以凸顯自己研究的新穎和價值；三是有些作者雖然引用了相關文獻，但并沒有結合自身的研究，討論過程中導致文章分割，讀者無法深入了解作者的研究結果。
　　六、對于理論性較強、需要某些數學輔助手段的文章，除非文章的目的是證明數學假設的內容，否則應避免過于詳細地進行數學推演。畢竟這是以數學為工具，而不是單純的數學問題。如果有必要詳述整個過程，可以采用附錄的形式進行標注以供讀者參閱。
　　七、討論過程中應指明作者的研究潛在的局限和缺點。有些作者不喜歡談自己研究的不足，似乎這樣會使得自己的工作看起來有缺陷，甚至選題有問題。這其實也是大環境造成的，但應當要盡力摒棄這種思維方式。指明局限性，不僅可以為后來的研究者提供參考，更能增加文章的客觀性。
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