醫學論文的討論，一般需要將所得的結論或研究結果，從理論上進一步認真分析，科學地推論和評價，證實所得結果的可靠性，闡明具有科學性、先進性的論據，從而取得大家的公認。從SCI期刊上收錄的文章，我們也可以發現，討論部分對背景的交代一般都是一帶而過，比較注重的是對文章所得結果的剖析以及與以往研究的對比。總體上來說，醫學SCI論文整個討論的寫作，一般可分成以下幾個部分。
　　一、背景介紹：主要是再次強調本文的臨床意義和研究價值。說到這一點，國內很多作者都是以沒有人做過類似的工作，本文首次報道等理由來強調文章的研究價值，這是非常牽強的。首先，為什么別人都不做這個工作，是因為沒有價值還是因為別人都沒有想到？其次，真的是第一次報道或者說首次發現嗎？另外，一項工作的價值不在于首次做，而是在于能夠解決沒有解決的問題，或者在現在的醫學水平上，指出突破現有水平的方向。
　　其實在SCI期刊上，真正完全原創性的醫學工作并不多。很多工作都僅僅是在現有的臨床基礎上，做一點點的改進，或者一點點的推進。所以在寫作時，大可以實事求是的說明，本文在某個小方面的貢獻，而不用過分夸大自己的研究成果。
　　二、研究結果解釋和比較：這部分寫作首先需要對結果進行合理地推理。有些作者在寫作時，僅僅將數據結果復述一下就完成討論了，而這些結果能夠說明什么問題卻只字不提，這只能說明作者自己也不理解自己的工作是在做什么，那又怎么能讓讀者去理解你的工作呢？還有一些作者，一點點的結果就可以吹得天花亂墜，這也是不適當的，因為這樣會引起讀者反感，而且在討論部分吹得過大，評審人員可能就你所提到的一些東西，要求你補充數據結果，這就給文章的發表，造成很大的麻煩。
　　其次，需要我們去用以往的研究，佐證本文的工作，或者佐證本文研究的不同之處。有些作者可能不是很理解，自己做的工作還需要別人的工作來佐證嗎，結果就可以說明一切了啊。其實，這樣做既是考察本文工作的含金量，也是考察作者在此領域的專業水平。
　　此外，在一篇醫學SCI論文中，可能有多個方面的結果，那么在討論中這些結果的意義都要提到嗎？其實，醫學領域的SCI論文，勢必要測定多項指標，根據這些指標來判斷研究意義，在討論過程中可以分以下幾種情況處理：
　　1.所有指標都符合預期，這種情況撰寫討論時就相對輕松一些，不過要分清主要結果與次要結果，寫作時以重點指標為主，輔以其他指標的補充。
　　2.部分指標并不符合預期，這種情況也不要否認結果，而是要通過其他的專業文獻對該現象進行有力地解釋，比如預期應該為陽性結果，而實驗所得數據為陰性，在排除試驗因素后，就要著手查閱其他文獻的信息，并根據其他可能的相關指標對該現象進行解釋。在醫學研究領域，無論是陰性還是陽性，只要能解決問題，一樣可以得到發表的機會，這其中的關鍵就看討論部分的撰寫。
　　三、研究的局限性：也就是說本文工作還有什么需要改進之處。局限性一般主要是針對研究設計方面存在的問題，實事求是地將存在的問題講清楚，并結合結果的缺陷進行合理地說明，點明如果進行彌補，可能使研究更完善。例如說，樣本量不大的情況下，先說明本文的結果已經能反映正確的趨勢或者規律，如果有更大的樣本量，可能得到的結果會更加準確。
　　四、總結和前景：有些期刊可能會要求單獨成段，作為總結部分獨立出來。主要是說明本文工作的結果可以得到什么樣的結論，本文工作對臨床有何意義，在本文的基礎上，進一步的工作方向在哪里。對結果科學意義和實際應用效果的表達要實事求是，適當留有余地。尤其要注意的是，不應該涉及文中不曾指出的事實，也不能在結論中重復SCI論文中其他章節中的句子，或者敘述其他不重要或與自己研究沒有密切關聯的內容。
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